review-paper-writing

Files (4)

• LICENSE.txt
• SKILL.md
• mcp-bio-research.md · references/
• tools-installation.md · references/

SKILL.md (first lines)

# Review Paper Writing

A comprehensive skill for writing literature review and survey papers using Claude Code. Combines MCP bio-research tools for literature search, scientific writing plugins for drafting, AI-powered research tools (2025-2026), and structured workflows for every phase from topic definition to submission.

## Quick Start

```bash
# Step 1: Install the Scientific Writer plugin
/plugin marketplace add https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-writer
/plugin install claude-scientific-writer
# Restart Claude Code, then:
/scientific-writer:init

# Step 2: Use the built-in paper skill
/paper

# Step 3: Initialize Bio-Research MCP tools (pre-installed)
/bio-research:start
```

> See [references/tools-installation.md](references/tools-installation.md) for detailed tool comparison and installation instructions.
> See [references/mcp-bio-research.md](references/mcp-bio-research.md) for MCP tool API reference.

---

## Review Paper Writing Workflow (7 Phases)

### Phase 1: Topic Definition & Scope

**Goal**: Define research questions and scope.

**Tools**: `/paper`, Scientific Writing skill

**Steps**:
1. Define 2-3 core research questions
2. Identify key terms and synonyms for search
3. Set inclusion/exclusion criteria
4. Choose review type (narrative, systematic, scoping, meta-analysis)

### Phase 2: Literature Search & Collection（增强版）

**Goal**: Systematically find and collect relevant papers using AI-powered tools.

**Tools**: PubMed MCP, bioRxiv MCP, Semantic Scholar, OpenAlex, Elicit, Research Rabbit, Connected Papers, Consensus, Scite.ai

#### 主要文献数据库

| 数据库 | 领域 | 特点 |
|--------|------|------|
| **PubMed / MEDLINE** | 生物医学 | 3300万+文献，MeSH词汇 |
| **Web of Science** | 综合 | 引用分析权威 |
| **Scopus** | 综合 | 欧洲偏重，指标丰富 |
| **Google Scholar** | 综合 | 覆盖最广，含灰色文献 |
| **Semantic Scholar** | 综合 | AI语义搜索，200M+论文 |
| **OpenAlex** | 综合 | 完全开源，250M+文献 |
| **Dimensions** | 综合 | 含专利和临床试验 |
| **IEEE Xplore** | 工程/CS | IEEE/IET出版物 |
| **ACM Digital Library** | CS | ACM出版物 |
| **arXiv** | CS/物理/数学/生物 | 预印本，最新成果 |
| **bioRxiv / medRxiv** | 生物医学 | 生物医学预印本 |
| **ChemRxiv** | 化学 | 化学预印本 |

#### AI 辅助文献工具（2025-2026最新）

```
# Semantic Scholar - 语义搜索 + TLDR摘要
访问: https://api.semanticscholar.org/graph/v1/paper/search
特点: 免费API，自动生成TLDR摘要，引用图谱分析
用法: 输入概念性查询，获取语义相似论文

# OpenAlex - 开源学术元数据
访问: https://api.openalex.org/works?search=<query>
特点: 完全免费，250M+文献，机构/概念分析
用法: 系统性检索，支持引用网络分析

# Elicit - AI结构化数据提取
访问: https://elicit.com
特点: 自动提取研究人群、方法、结果等结构化数据
用法: 输入研究问题，自动分析相关论文并提取关键信息

# Research Rabbit - 引用网络映射
访问: https://researchrabbitapp.com
特点: 从种子论文扩展发现相关工作，可视化引用网络
用法: 导入已知关键论文，探索相关论文空间

# Connected Papers - 图谱化文献发现
访问: https://www.connectedpapers.com
特点: 基于引用相似度的图谱化文献关联
用法: 输入核心论文，发现相关文献簇

# Consensus - 科学共识检查
访问: https://consensus.app
特点: 快速了解特定研究问题的学术共识
用法: 输入具体问题，获取文献支持的答案

# Scite.ai - 引用质量验证
访问: https://scite.ai
特点: 区分"支持"/"反驳"/"提及"三类引用关系
用法: 验证关键声明的文献支持度，发现争议性研究
```

**Steps**:
1. 在主要数据库运行系统性检索（使用标准化检索策略）
2. 用 Semantic Scholar 进行语义检索，捕获传统关键词可能遗漏的相关文献
3. 用 Research Rabbit 从关键种子论文扩展发现相关工作
4. 用 Connected Papers 发现主题相近的文献簇
5. 用 Elicit 自动提取结构化数据（人群、方法、结果）
6. 用 Scite.ai 验证关键引用的可靠性
7. 检查 arXiv/bioRxiv 获取最新预印本成果
8. 导出引用并按主题分类整理

> See [Multi-Database Search Workflow](references/mcp-bio-research.md#multi-database-search-workflow) for detailed steps.

### Phase 3: Literature Organization & Synthesis

**Goal**: Read, categorize, and synthesize findings.

**Tools**: Literature Review skill, Citation Management skill, PDF skill

From Hollis36/claude-skill, Apache-2.0.

More from Hollis36/claude-skill